Die Biologische Station Kreis Paderborn-Senne e.V. betreut in naturschutzfachlicher Hinsicht Schutzgebiete im Kreis Paderborn und in der Senne. In Absprache und Kooperation mit Behörden, Vereinen und Verbänden arbeiten die Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter der Biologischen Station in weiteren Projekten zu verschiedenen Themen aus Natur- und Artenschutz, Landschaftspflege, Umweltbildung und Regionalentwicklung.

Hauptaufgabe der Biologischen Station Kreis Paderborn – Senne ist die Betreuung von Naturschutzgebieten, FFH- und Vogelschutzgebieten im Kreis Paderborn und im Landschaftsraum Senne in den Kreisen Gütersloh und Lippe sowie in der kreisfreien Stadt Bielefeld. Die Betreuung der Schutzgebiete erfolgt in enger Abstimmung mit den unteren Landschaftsbehörden und mit dem Land Nordrhein-Westfalen, vertreten durch die Bezirksregierung Detmold.